Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc9P09633 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc9P09633 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc9P09633 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms