Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna9P09235 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms