Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefmP08553 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefmP08553 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefmP08553 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefmP08553 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NefmP08553 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefmP08553 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefmP08553 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefmP08553 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefmP08553 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NefmP08553 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefmP08553 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefmP08553 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NefmP08553 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NefmP08553 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NefmP08553 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NefmP08553 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms