Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NeflP08551 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NeflP08551 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeflP08551 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeflP08551 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeflP08551 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NeflP08551 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NeflP08551 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeflP08551 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeflP08551 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeflP08551 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeflP08551 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeflP08551 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 564.9 ms