Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me1P06801 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me1P06801 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me1P06801 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me1P06801 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me1P06801 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me1P06801 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me1P06801 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Me1P06801 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Me1P06801 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms