Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms