Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04945 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04945 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04945 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04945 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04945 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04945 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04945 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms