Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tk1P04184 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tk1P04184 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms