Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-AaP01910 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms