Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01798 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01798 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01798 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01798 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01798 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01798 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms