Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01655 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01655 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01655 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01655 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01655 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01655 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01655 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms