Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01649 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01649 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01649 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01649 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01649 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01649 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01649 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01649 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01649 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01649 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms