Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna1P01572 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna1P01572 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms