Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4bP01029 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4bP01029 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4bP01029 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4bP01029 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4bP01029 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4bP01029 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4bP01029 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4bP01029 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4bP01029 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4bP01029 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4bP01029 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4bP01029 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4bP01029 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4bP01029 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4bP01029 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4bP01029 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4bP01029 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4bP01029 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4bP01029 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4bP01029 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms