Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtatp6P00848 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtatp6P00848 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms