Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lancl1O89112 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lancl1O89112 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms