Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl20O89093 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl20O89093 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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