Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CpdO89001 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CpdO89001 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CpdO89001 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CpdO89001 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CpdO89001 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CpdO89001 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CpdO89001 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CpdO89001 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CpdO89001 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CpdO89001 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CpdO89001 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CpdO89001 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CpdO89001 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CpdO89001 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms