Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MscO88940 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MscO88940 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MscO88940 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MscO88940 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MscO88940 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MscO88940 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MscO88940 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MscO88940 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms