Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tom1O88746 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1O88746 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tom1O88746 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tom1O88746 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tom1O88746 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms