Protein–RNA interactions for Protein: O88728

Ifitm5, Interferon-induced transmembrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm5O88728 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm5O88728 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm5O88728 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm5O88728 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm5O88728 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms