Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CntfrO88507 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CntfrO88507 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CntfrO88507 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CntfrO88507 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CntfrO88507 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CntfrO88507 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CntfrO88507 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfrO88507 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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