Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkcO88445 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AurkcO88445 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AurkcO88445 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms