Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vti1bO88384 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vti1bO88384 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vti1bO88384 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vti1bO88384 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vti1bO88384 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms