Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfdp1O88271 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfdp1O88271 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms