Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm10509O88255 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm10509O88255 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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