Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb5O70309 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb5O70309 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms