Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms