Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf5O70191 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf5O70191 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf5O70191 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms