Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chrna4O70174 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chrna4O70174 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrna4O70174 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms