Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RngttO55236 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RngttO55236 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RngttO55236 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RngttO55236 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RngttO55236 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RngttO55236 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RngttO55236 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RngttO55236 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RngttO55236 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RngttO55236 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RngttO55236 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms