Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad51dO55230 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad51dO55230 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms