Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26a1O55127 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26a1O55127 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms