Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nipsnap2O55126 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap2O55126 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms