Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nipsnap1O55125 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap1O55125 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms