Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NlkO54949 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NlkO54949 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NlkO54949 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NlkO54949 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NlkO54949 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NlkO54949 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NlkO54949 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NlkO54949 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms