Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf12O54907 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf12O54907 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms