Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffbO54788 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffbO54788 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffbO54788 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffbO54788 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffbO54788 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DffbO54788 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms