Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CrxO54751 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxO54751 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxO54751 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CrxO54751 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CrxO54751 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CrxO54751 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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