Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FxnO35943 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FxnO35943 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FxnO35943 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FxnO35943 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FxnO35943 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FxnO35943 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FxnO35943 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms