Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pik3cdO35904 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pik3cdO35904 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms