Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stag2O35638 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stag2O35638 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stag2O35638 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stag2O35638 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag2O35638 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms