Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccrl2O35457 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccrl2O35457 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms