Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrt1O35449 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrt1O35449 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms