Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PhyhO35386 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms