Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad6O35182 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms