Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nedd9O35177 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nedd9O35177 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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