Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif1cO35071 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif1cO35071 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms