Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms