Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Casp6O08738 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Casp6O08738 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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